Fortis Türkiye Kupası’nda çeyrek final eşleşmeleri belli oldu. Galatasaray zorlu bir kura çekti. Gruplarını ilk iki sırada tamamlayan kulüplerin katıldığı kura çekiminde eşleşmeler şu şekilde oluştu:
Fenerbahçe – Bursaspor Galatasaray – Sivasspor Antalyaspor – Beşiktaş Denizlispor – Ankaraspor
İlk maçlar 28 Ocak’ta oynanırken, ikinci maçlar ise 4 Şubat 2009 tarihinde oynanacak. Fenerbahçe, Galatasaray, Antalyaspor ve Denizlispor ilk maçları evlerinde oynayacak.
