Oluşturulan forum yanıtları
- Yazılar
-
baya oldu heyy alttaki en son ne zaman çok ama çok sinirlenip ne yapacagını bilmez halde ortalarda dolaştın
ben tamir ederken genelde daha çok bozuyorum ama istersen bi deneyeyim heyy alttaki bi biskrem wersem viroloji sorularını bulurmusun
polimorfizm:Bir gen veya kromozomun bir toplumda, iki veya daha fazla, sık rastlanan allelinin varlığı. Allel sayısı arttıkça toplumda o gen için polimorfizm artar.
POLIMORFIZM: Yakın zamana kadar bir proteinin davranış farklılığı; enzimatik aktivitesi veya elektroforetik mobilitesi ile belirleniyordu. O nedenle de genetik analizler için gerekli olan polimorfizmler, sınırlı olarak bulunmaktaydı. Bu durum RElerin keşfi ile dramatik olarak değişmiştir.
Bir popülasyonda mevcut olan genetik çeşitliliğe polimorfizm denir. Bu doğal farklılıklar kuşaktan kuşağa Mendel yasalarına göre aktarılırlar.
İnsan genomunda tek baz değişiklikleri çok sıktır. Bazılarına göre bu sIklIk her 100 baz çiftinde bir olarak ortaya çıkmaktadır. Bu nükleotid değişikliklerinin büyük çoğunluğu zararsızdır.
DNA Polimorfizmi, DNA üzerinde hastalığa neden olmayan, suskun nükleotid değişimleri olarak tanımlanır. Eğer bu polimorfizmler, bir restriksiyon enzimi kesme bölgesinin yok olmasına ya da yeniden oluşmasına neden olurlarsa; kolaylıkla saptanabilirler.DNA, bu enzimlerle kesildiğinde farklı uzunlukta parçalar oluşur ve analizlerde değişik pozisyonlarda görülürler. Bunlara Restriction fragment length polimorphism (RFLP) / Restriktion enzimi uzunluk polimorfizmleri diyoruz.
Eğer bir birey, RFLP için heterozigot ise, o takdirde birey bilgilendirici (INFORMATIF) olarak tanımlanır. Böylece bu kromozomların / işaretlerin nesilden nesile geçmelerini incelemek mümkün hale gelir.
Saptanan değişiklik bir gene yakın (Linked) olduğunda; gendeki hatanın bu polimorfizme paralel gittiği varsayılır. Bu gene INDIREKT YAKLASIM olarak tanımlanabilir.
RFLP analizinin temeli, anne ve babanın iki ayrı alleli taşıyan iki kromozomunun birbirinden ayırt edilmesine ve aile içinde daha önceden bulunan hasta bir çocuk yardımı ile hangi kromozomun riskli olduğunun, yani hangi kromozomun mutasyona uğramış alleli (yani bozuk geni) taşıdığının saptanmasına dayanır.
RFLP analizinde, iki kromozom birbirinden gen içinde ya da gen yakınında bulunan bir DNA polimorfizminin bulunması (+); ya da bulunmaması (-) ile ayrılır.
Analizin kesinliği kullanılan polimorfik işaretin, hastalık loküsüne yakınlığı ile doğrudan ilişkilidir. Hastalık loküsüne mümkün olduğunca yakın; gen içi işaretlerin kullanımı tanının kesinliğini % 99a kadar arttırır. Kullanılan genetik işaret ve hastalık loküsü birbirine ne kadar yakınsa rekombinasyon olasılığı o kadar küçüktür ki bu da analiz için avantajdır.
Homolog kromozomlar, meiosis sırasında birleşirlerken, rekombinasyon denilen olayda parça değişimleri ortaya çıkar. RFLP genden ne kadar uzaktaysa; rekombinasyon olasılığı o denli artar.
Rekombinasyon ünitesi centimorgandir (TH Morgana atfen) 1 cm ya da 106 bpe eşittir. Bir gene 5 cm uzaklıktaki bir işaretleyicinin genetik danışmada kullanılabileceği genel olarak kabul edilir. 5 cmlik linkage (ilişkinin) anlamı %95lik doğruluk oranını verir. Yani 1/20 olasılıkla bir crossingover oluşabilir. Rekombinasyonun ciddi sonuçlar doğuracağını bilmekte yarar vardır. Eğer marker ile gen arasındaki bölgede, bir crossover oluşursa o takdirde marker ile gen arasındaki ilişki ortadan kalkar ve yanlış sonuç alınır.
Doğruluk oranı, bilgilendirici RFLPlerin genin her iki yanından (FLANKING) alınması ile arttırılabilir. Böylece krossoverin saptanması mümkün olabilir. RFLP, genden 5 cmdan daha az uzakta ise, iki taraflı crossover şansı 1/400 veya daha azdır. İki taraflı bilgilendirici RFLP olması halinde doğruluk sansı %99a çıkar. Bu iki marker klonlama içinde önemlidir çünkü gen ikisinin arasında yer almaktadır.
Linkage analizinde bir gen ile işaretleyicinin birlikteliği araştırılır. Bunların kalıtım şeklinin gözlenme olasılığı (sadece şans eseri de olabileceğinden) hesaplanır. Hesaplamalar, kalıtım derecesinin varoluşu olasılığına dayanarak tekrarlanır. Bu iki olasılığın birbirlerine olan olasılığı hesaplanır. Bu oranın logaritması kullanıldığından Logaritm of the odds veya lod score olarak bilinir. Pratik yönden eğer lod score 3ün üzerinde ise, gen ve işaret birbirleri ile bağıntılıdır. Bu hesaplamalar, bilgisayar kullanımı ile hızlanmıştır.
